MuSeek Barcode Set 1 Ion Torrent

Zestaw Thermo Scientific MuSeek Barcode Set 1, Ion Torrent™ jest przeznaczony do tworzenia wysokiej jakości bibliotek genowych do sekwencjonowania. W skład zestawu wchodzi 1-16 mieszanin adapter-primer, z których każda pozwala na addycję sekwencji z barkodem kompatybilną z systemem Ion Personal Genome Machine™ (PGM™). Pozwala to na zebranie do 16 bibliotek fragmentów, selekcję ich długości oraz PCR, a następnie przeprowadzenie analizy sekwencyjnej.
MuSeek Barcode Set 1 w połączeniu z MuSeek Library Preparation Kit for Ion Torrent™ umożliwia szybką I łatwą konstrukcje bibliotek fragmentów z barkodem ze 100 ng próbki DNA, tym samym eliminuje potrzebę osobnych etapów cięcia i ligacji adapterów.

Właściwości
Umożliwia multiplex do 16 bibliotek fragmentów próbek podczas jednego procesu sekwencjonowania.
Równorzędna reprezentacja wszystkich bibliotek.

Zastosowanie
Przygotowanie bibliotek fragmentów DNA do dalszego sekwencjonowania NGS.

Skład zestawu
MuSeek Barcode Adapter Primer Mix 1-16

Reakcja fragmentacji i tagowania katalizowana jest przez kompleks transpozazy MuA (białko o masie 75 kDa pochodzące z bakteriofaga Mu) posiadający dwa dwuniciowe końce DNA z sekwencją specyficzną dla MuA.
W pierwszej fazie genomowe DNA jest jednocześnie dzielone na fragmenty i oznakowywane sekwencjami transpozonów na każdym końcu każdego fragmentu. Następnie końce 3’ są wydłużane ponad 5-cio nukleotydowe przerwy wygenerowane podczas reakcji transpozycji. Do fragmentów dodawane są specyficzne adaptery z wykorzystaniem reakcji PCR.